Análisis e Interpretación de Datos 'ómicos'

COORDINADOR: Joaquín Dopazo (Fundación Progreso y Salud)

Esta asignatura presenta una visión actualizada del campo de la genómica y transcriptómica desde una perspectiva bioinformática aplicada a la salud. Está especialmente enfocada en el contexto de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva (NGS), y sus implicaciones metodológicas y analíticas en bioinformática. Los alumnos reciben formación teórico-práctica acerca de las herramientas que se emplean actualmente para el manejo de conjuntos de secuencias procedentes de estas tecnologías. Además, exploran y trabajan con datos multi-ómicos obtenidos de bases de datos públicas.

PROGRAMA

Tema 1. Introducción a la Secuenciación
Tema 2. Introducción al análisis transcriptómico
Tema 3. Análisis Supervisado – Expresión Diferencial
Tema 4. Análisis no Supervisado – Clustering y predictores
Tema 5. Análisis Funcional de Datos ‘Ómicos’
Tema 6. Interpretación Avanzada: GSEA
Tema 7. Interpretación avanzada: Análisis de Redes
Tema 8. Análisis e Interpretación experimentos de RNAseq
Tema 9. Herramientas y DDBBs genómicas médicas
Tema 10. Alineadores y formatos de los datos
Tema 11. Interpretación Avanzada – Análisis de rutas moleculares
Tema 12. Mutaciones I – Identificación de Variantes
Tema 13. Mutaciones II – Anotación y Filtro de Variantes
Tema 14. Mutaciones III – Interpretación
Tema 15. Análisis CNVs
Tema 16. Priorización alteraciones en enfermedades raras
Tema 17. Genes y Enfermedad
Tema 18. GWAS (Genome-Wide Association Studies)
Tema 19. Epidemiología Molecular
Tema 20. Bioinformática aplicada a Microbiología Clínica
Tema 21. Introducción al Análisis de Metilación