Esta asignatura presenta una visión actualizada del campo de las multi-ómicas (genómica, transcriptómica, epigenómica, etc.) desde la perspectiva bioinformática y aplicada al área de la salud. Está especialmente enfocada en el contexto de las tecnologías de secuenciación masiva y sus implicaciones metodológicas y analíticas en bioinformática. Los estudiantes reciben formación teórico-práctica acerca de los métodos y herramientas que se emplean actualmente para el manejo de conjuntos de datos procedentes de estas tecnologías. Además, exploran y trabajan en el aula con datos multi-ómicos obtenidos de bases de datos públicas. La evaluación de la asignatura se efectúa mediante examen teórico y trabajos prácticos con datos reales.

PROGRAMA

Tema 1. Introducción a las técnicas de secuenciación masiva
Tema 2. Alineadores y formatos de los datos
Tema 3. SNVs I – Identificación de variantes
Tema 4. Herramientas y BBDD genómico-médicas
Tema 5. SNVs II – Anotación y filtrado de variantes
Tema 6. SNVs III – Análisis e interpretación de variantes somáticas
Tema 7. SNVs IV – Análisis e interpretación de variantes germinales
Tema 8. SNVs V – Interpretación de SNVs en la clínica
Tema 9. Análisis de SNPs y estudios de asociación (GWAS)
Tema 10. Epidemiología molecular
Tema 11. Análisis de variantes estructurales (CNVs)
Tema 12. Análisis de genomas completos (WGS)
Tema 13. Introducción al análisis transcriptómico
Tema 14. Análisis de RNA-seq
Tema 15. Expresión génica diferencial
Tema 16. Clustering y predictores
Tema 17. Interpretación funcional de datos ‘ómicos’
Tema 18. Interpretación funcional avanzada I: Grupos de genes (GSEA)
Tema 19. Interpretación funcional avanzada II: Análisis de redes
Tema 20. Análisis de datos ‘single-cell‘
Tema 21. Proteómica
Tema 22. Epigenómica
Tema 23. Nutrigenómica
Tema 24. Análisis de microbiomas
Tema 25. Bioinformática y microbiología clínica